Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms