Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Odf3Q920N1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Odf3Q920N1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Odf3Q920N1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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