Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp3Q91W36 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms