Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms