Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp4Q8VHC5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms