Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Stx18Q8VDS8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Stx18Q8VDS8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Stx18Q8VDS8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Stx18Q8VDS8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stx18Q8VDS8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms