Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD75

Hip1, Huntingtin-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1Q8VD75 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1Q8VD75 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1Q8VD75 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1Q8VD75 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1Q8VD75 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1Q8VD75 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1Q8VD75 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1Q8VD75 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1Q8VD75 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1Q8VD75 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1Q8VD75 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1Q8VD75 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1Q8VD75 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1Q8VD75 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hip1Q8VD75 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms