Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ApobrQ8VBT6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms