Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms