Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnaaf4Q8R368 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233.6 ms