Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B8

Rorb, Nuclear receptor ROR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorbQ8R1B8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
RorbQ8R1B8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms