Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms