Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog3Q8CI04 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms