Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnka2ipQ8CH19 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms