Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc43a2Q8CGA3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc43a2Q8CGA3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc43a2Q8CGA3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc43a2Q8CGA3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc43a2Q8CGA3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc43a2Q8CGA3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc43a2Q8CGA3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc43a2Q8CGA3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc43a2Q8CGA3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc43a2Q8CGA3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc43a2Q8CGA3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms