Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx8Q8CFD4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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