Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc17Q8CE13 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms