Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms