Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
4930507D05RikQ8C9C9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms