Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apol7cQ8C6E1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms