Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z3

Ssxb2, Synovial sarcoma, X member B2, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb2Q8C5Z3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms