Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
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Ccdc113Q8C5T8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Ccdc113Q8C5T8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Ccdc113Q8C5T8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
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