Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms