Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp47Q8BY87 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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