Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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