Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cldn17Q8BXA6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cldn17Q8BXA6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cldn17Q8BXA6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cldn17Q8BXA6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cldn17Q8BXA6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn17Q8BXA6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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