Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TtpaQ8BWP5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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TtpaQ8BWP5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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TtpaQ8BWP5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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TtpaQ8BWP5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TtpaQ8BWP5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms