Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smarcal1Q8BJL0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms