Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms