Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc50Q810U5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms