Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc155Q80VJ8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc155Q80VJ8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms