Protein–RNA interactions for Protein: Q80UB0

Testin-2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80UB0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q80UB0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q80UB0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q80UB0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q80UB0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q80UB0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q80UB0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q80UB0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q80UB0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q80UB0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q80UB0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q80UB0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q80UB0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80UB0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80UB0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80UB0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80UB0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80UB0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80UB0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80UB0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80UB0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80UB0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80UB0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80UB0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80UB0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80UB0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80UB0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80UB0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80UB0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80UB0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80UB0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80UB0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80UB0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80UB0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80UB0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80UB0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80UB0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80UB0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80UB0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80UB0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80UB0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80UB0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80UB0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80UB0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80UB0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80UB0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80UB0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80UB0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80UB0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80UB0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80UB0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80UB0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80UB0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80UB0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80UB0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80UB0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80UB0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80UB0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80UB0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80UB0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80UB0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80UB0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80UB0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80UB0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80UB0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80UB0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80UB0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80UB0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80UB0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80UB0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80UB0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80UB0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80UB0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80UB0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80UB0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80UB0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80UB0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80UB0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80UB0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80UB0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80UB0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80UB0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80UB0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80UB0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q80UB0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q80UB0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q80UB0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q80UB0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q80UB0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q80UB0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q80UB0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q80UB0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q80UB0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q80UB0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q80UB0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q80UB0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q80UB0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q80UB0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q80UB0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q80UB0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms