Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Phf8Q80TJ7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf8Q80TJ7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms