Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClmQ7TSN2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms