Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms