Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Vma21Q78T54 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Vma21Q78T54 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vma21Q78T54 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vma21Q78T54 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vma21Q78T54 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Vma21Q78T54 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vma21Q78T54 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vma21Q78T54 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vma21Q78T54 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vma21Q78T54 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vma21Q78T54 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vma21Q78T54 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vma21Q78T54 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vma21Q78T54 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vma21Q78T54 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vma21Q78T54 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vma21Q78T54 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vma21Q78T54 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vma21Q78T54 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vma21Q78T54 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vma21Q78T54 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vma21Q78T54 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vma21Q78T54 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Vma21Q78T54 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Vma21Q78T54 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Vma21Q78T54 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Vma21Q78T54 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Vma21Q78T54 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Vma21Q78T54 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Vma21Q78T54 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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