Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Topbp1Q6ZQF0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Topbp1Q6ZQF0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms