Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
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