Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rhox8Q6VSS7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rhox8Q6VSS7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms