Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bnip1Q6QD59 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms