Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kdm2bQ6P1G2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm2bQ6P1G2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms