Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Paxip1Q6NZQ4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms