Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg16l2Q6KAU8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms