Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Krt40Q6IFX3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt40Q6IFX3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
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