Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm5416Q6IE28 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm5416Q6IE28 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm5416Q6IE28 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm5416Q6IE28 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm5416Q6IE28 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm5416Q6IE28 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm5416Q6IE28 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm5416Q6IE28 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5416Q6IE28 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm5416Q6IE28 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms