Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp4eQ66X19 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms