Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf4Q64310 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms