Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

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Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Defa17Q64016 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa17Q64016 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa17Q64016 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Defa17Q64016 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa17Q64016 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa17Q64016 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa17Q64016 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Defa17Q64016 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Defa17Q64016 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa17Q64016 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa17Q64016 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa17Q64016 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa17Q64016 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa17Q64016 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Defa17Q64016 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa17Q64016 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa17Q64016 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Defa17Q64016 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Defa17Q64016 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Defa17Q64016 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Defa17Q64016 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Defa17Q64016 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Defa17Q64016 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Defa17Q64016 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Defa17Q64016 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa17Q64016 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms