Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ift52Q62559 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms