Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcncQ62447 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CcncQ62447 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms